Protein–RNA interactions for Protein: Q15669

RHOH, Rho-related GTP-binding protein RhoH, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOHQ15669 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOHQ15669 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOHQ15669 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOHQ15669 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOHQ15669 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOHQ15669 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms