Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SURF1Q15526 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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