Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3A2Q15428 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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