Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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PTPRRQ15256 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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PTPRRQ15256 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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PTPRRQ15256 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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PTPRRQ15256 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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PTPRRQ15256 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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PTPRRQ15256 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRRQ15256 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRRQ15256 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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