Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SHPRHQ149N8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SHPRHQ149N8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
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