Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCAPQ14761 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRCAPQ14761 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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