Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SSPNQ14714 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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