Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP1BQ14684 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RRP1BQ14684 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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