Protein–RNA interactions for Protein: Q14397

GCKR, Glucokinase regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCKRQ14397 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCKRQ14397 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCKRQ14397 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCKRQ14397 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms