Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBI3Q14213 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EBI3Q14213 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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