Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CNGB1Q14028 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
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