Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNX3Q13761 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX3Q13761 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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