Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NEUROD1Q13562 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEUROD1Q13562 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEUROD1Q13562 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
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