Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC1Q13547 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
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