Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF4BQ13523 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF4BQ13523 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms