Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TUSC3Q13454 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUSC3Q13454 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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