Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTA1Q13424 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNTA1Q13424 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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