Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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