Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAF1AQ13111 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms