Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFSWAPQ12872 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SFSWAPQ12872 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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