Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP160Q12769 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP160Q12769 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP160Q12769 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
NUP160Q12769 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NUP160Q12769 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NUP160Q12769 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NUP160Q12769 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms