Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 CTT1YGR088W 1689 nt5.43□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YCR006CYCR006C 474 nt5.43□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 DCD1YHR144C 939 nt5.43□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.43□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 ARC40YBR234C 1155 nt5.43□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 BUD7YOR299W 2241 nt5.43□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 PDR10YOR328W 4695 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 HSP82YPL240C 2130 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 RAD16YBR114W 2373 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 URA3YEL021W 804 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YNG2YHR090C 849 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 MRS3YJL133W 945 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YJL215CYJL215C 360 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YKL107WYKL107W 930 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 APS1YLR170C 471 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 ATP14YLR295C 375 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YLR346CYLR346C 306 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 PRE7YBL041W 726 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 CWC25YNL245C 540 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YPR150WYPR150W 522 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 AVO1YOL078W 3531 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 COT1YOR316C 1320 nt5.42□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 SER33YIL074C 1410 nt5.41□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.41□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 RRB1YMR131C 1536 nt5.41□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 ECM7YLR443W 1347 nt5.41□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 HIR2YOR038C 2628 nt5.41□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YAP1802YGR241C 1707 nt5.4□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 ZPR1YGR211W 1461 nt5.4□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 DOM34YNL001W 1161 nt5.4□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YPL199CYPL199C 723 nt5.4□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 ARN1YHL040C 1884 nt5.4□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 PMA1YGL008C 2757 nt5.4□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 APC4YDR118W 1959 nt5.4□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 MTC1YJL123C 1437 nt5.4□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 IMA3YIL172C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 IMA4YJL221C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 PAH1YMR165C 2589 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 YPL071CYPL071C 471 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 EAR1YMR171C 1653 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 TUB3YML124C 1338 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 PRP40YKL012W 1752 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 SYP1YCR030C 2613 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 PUT1YLR142W 1431 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 STP4YDL048C 1473 nt5.39□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 GIP2YER054C 1647 nt5.38□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 TFB3YDR460W 966 nt5.38□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 RPL34AYER056C-A 366 nt5.38□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 YKR073CYKR073C 321 nt5.38□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 RSA3YLR221C 663 nt5.38□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 YIL092WYIL092W 1902 nt5.38□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 MET4YNL103W 2019 nt5.38□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 APL6YGR261C 2430 nt5.37□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 YJR012CYJR012C 624 nt5.37□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.37□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 MRPL24YMR193W 777 nt5.37□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 SAP4YGL229C 2457 nt5.37□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 OLE1YGL055W 1533 nt5.37□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 BLM10YFL007W 6432 nt5.37□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 MOT2YER068W 1764 nt5.37□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 PCA1YBR295W 3651 nt5.36□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 SPC97YHR172W 2472 nt5.36□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 DON1YDR273W 1098 nt5.36□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 EAF5YEL018W 840 nt5.36□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 PRD1YCL057W 2139 nt5.36□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 ISR1YPR106W 1332 nt5.35□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 FBP1YLR377C 1047 nt5.35□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 CKB2YOR039W 777 nt5.35□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 COA2YPL189C-A 207 nt5.35□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 POP4YBR257W 840 nt5.35□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 MDR1YGR100W 2853 nt5.34□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 ATG18YFR021W 1503 nt5.34□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 PER1YCR044C 1074 nt5.34□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 SNA2YDR525W-A 240 nt5.34□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 YGR016WYGR016W 573 nt5.34□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 YGR066CYGR066C 879 nt5.34□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 YML131WYML131W 1098 nt5.34□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 TGS1YPL157W 948 nt5.34□□□□□ -1.55
LSP1Q12230 MSE1YOL033W 1611 nt5.34□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 PAN1YIR006C 4443 nt5.33□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 ECM2YBR065C 1095 nt5.33□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 HAL1YPR005C 885 nt5.33□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 MSC2YDR205W 2175 nt5.33□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 AIM10YER087W 1731 nt5.32□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 snR7-SsnR7-S 179 nt5.32□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 SNF11YDR073W 510 nt5.32□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 PRE2YPR103W 864 nt5.32□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 HPC2YBR215W 1878 nt5.32□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 CAB3YKL088W 1716 nt5.31□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 PDR15YDR406W 4590 nt5.31□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 ARG82YDR173C 1068 nt5.31□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 RNA15YGL044C 891 nt5.31□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 LYS5YGL154C 819 nt5.31□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 RDL1YOR285W 420 nt5.31□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 MKC7YDR144C 1791 nt5.31□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 NUP116YMR047C 3342 nt5.31□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 YNL134CYNL134C 1131 nt5.3□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 DNF2YDR093W 4839 nt5.3□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 VBA2YBR293W 1425 nt5.3□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 TUB2YFL037W 1374 nt5.29□□□□□ -1.56
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