Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC10A7Q0GE19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC10A7Q0GE19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC10A7Q0GE19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms