Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms