Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LOXL1Q08397 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LOXL1Q08397 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms