Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC3A1Q07837 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms