Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN1BQ07699 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN1BQ07699 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms