Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKAP4Q07065 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP4Q07065 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms