Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRKCDQ05655 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms