Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN1Q04323 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms