Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUCB1Q02818 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUCB1Q02818 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUCB1Q02818 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms