Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNB1Q02641 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB1Q02641 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms