Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MUC3AQ02505 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MUC3AQ02505 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms