Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP4Q02446 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP4Q02446 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP4Q02446 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SP4Q02446 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP4Q02446 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP4Q02446 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP4Q02446 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SP4Q02446 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP4Q02446 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP4Q02446 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP4Q02446 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SP4Q02446 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP4Q02446 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP4Q02446 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP4Q02446 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP4Q02446 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP4Q02446 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP4Q02446 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP4Q02446 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SP4Q02446 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP4Q02446 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP4Q02446 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP4Q02446 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP4Q02446 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP4Q02446 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SP4Q02446 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SP4Q02446 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SP4Q02446 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SP4Q02446 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SP4Q02446 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP4Q02446 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP4Q02446 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP4Q02446 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP4Q02446 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP4Q02446 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP4Q02446 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP4Q02446 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SP4Q02446 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP4Q02446 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SP4Q02446 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP4Q02446 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP4Q02446 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP4Q02446 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP4Q02446 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP4Q02446 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SP4Q02446 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP4Q02446 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP4Q02446 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP4Q02446 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP4Q02446 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP4Q02446 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP4Q02446 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP4Q02446 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP4Q02446 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP4Q02446 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP4Q02446 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms