Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTBN1Q01082 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms