Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFKB2Q00653 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms