Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2BQ00403 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2BQ00403 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2BQ00403 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms