Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms