Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX1P83916 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX1P83916 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX1P83916 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX1P83916 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX1P83916 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX1P83916 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX1P83916 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX1P83916 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX1P83916 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX1P83916 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX1P83916 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX1P83916 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX1P83916 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX1P83916 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX1P83916 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX1P83916 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX1P83916 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX1P83916 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX1P83916 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX1P83916 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX1P83916 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX1P83916 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX1P83916 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX1P83916 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX1P83916 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX1P83916 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX1P83916 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX1P83916 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX1P83916 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX1P83916 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX1P83916 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX1P83916 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX1P83916 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX1P83916 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX1P83916 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX1P83916 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX1P83916 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX1P83916 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX1P83916 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX1P83916 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX1P83916 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX1P83916 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX1P83916 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CBX1P83916 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX1P83916 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX1P83916 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX1P83916 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX1P83916 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX1P83916 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX1P83916 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX1P83916 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX1P83916 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX1P83916 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX1P83916 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms