Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP5P82980 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP5P82980 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBP5P82980 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP5P82980 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP5P82980 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP5P82980 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP5P82980 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP5P82980 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP5P82980 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP5P82980 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP5P82980 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBP5P82980 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP5P82980 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP5P82980 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP5P82980 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP5P82980 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP5P82980 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP5P82980 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBP5P82980 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP5P82980 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP5P82980 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP5P82980 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP5P82980 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP5P82980 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBP5P82980 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBP5P82980 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBP5P82980 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBP5P82980 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBP5P82980 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBP5P82980 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBP5P82980 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBP5P82980 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBP5P82980 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBP5P82980 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBP5P82980 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBP5P82980 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBP5P82980 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBP5P82980 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBP5P82980 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBP5P82980 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBP5P82980 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBP5P82980 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBP5P82980 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBP5P82980 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBP5P82980 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBP5P82980 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBP5P82980 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBP5P82980 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBP5P82980 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBP5P82980 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBP5P82980 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBP5P82980 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBP5P82980 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBP5P82980 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBP5P82980 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBP5P82980 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBP5P82980 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBP5P82980 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBP5P82980 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBP5P82980 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBP5P82980 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBP5P82980 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms