Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUCB2P80303 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms