Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFI35P80217 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFI35P80217 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFI35P80217 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFI35P80217 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFI35P80217 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFI35P80217 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFI35P80217 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFI35P80217 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFI35P80217 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFI35P80217 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFI35P80217 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFI35P80217 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFI35P80217 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFI35P80217 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFI35P80217 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFI35P80217 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFI35P80217 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFI35P80217 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFI35P80217 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFI35P80217 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFI35P80217 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFI35P80217 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFI35P80217 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFI35P80217 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFI35P80217 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFI35P80217 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFI35P80217 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFI35P80217 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFI35P80217 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFI35P80217 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFI35P80217 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFI35P80217 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFI35P80217 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFI35P80217 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFI35P80217 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFI35P80217 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFI35P80217 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFI35P80217 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFI35P80217 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFI35P80217 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFI35P80217 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFI35P80217 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFI35P80217 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFI35P80217 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFI35P80217 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFI35P80217 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFI35P80217 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFI35P80217 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFI35P80217 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFI35P80217 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFI35P80217 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFI35P80217 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFI35P80217 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFI35P80217 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms