Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HBBP68871 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HBBP68871 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HBBP68871 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HBBP68871 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HBBP68871 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HBBP68871 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HBBP68871 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HBBP68871 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HBBP68871 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HBBP68871 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HBBP68871 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HBBP68871 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HBBP68871 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HBBP68871 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HBBP68871 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HBBP68871 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HBBP68871 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HBBP68871 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HBBP68871 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HBBP68871 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HBBP68871 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HBBP68871 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HBBP68871 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HBBP68871 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HBBP68871 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HBBP68871 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HBBP68871 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HBBP68871 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HBBP68871 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HBBP68871 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms