Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms