Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM4P67936 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM4P67936 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM4P67936 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM4P67936 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM4P67936 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM4P67936 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM4P67936 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM4P67936 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM4P67936 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM4P67936 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM4P67936 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM4P67936 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM4P67936 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM4P67936 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM4P67936 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM4P67936 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM4P67936 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM4P67936 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM4P67936 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM4P67936 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM4P67936 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM4P67936 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM4P67936 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM4P67936 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM4P67936 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM4P67936 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM4P67936 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM4P67936 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM4P67936 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM4P67936 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM4P67936 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM4P67936 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM4P67936 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM4P67936 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM4P67936 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM4P67936 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM4P67936 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM4P67936 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM4P67936 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM4P67936 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM4P67936 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM4P67936 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM4P67936 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms