Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNC1P63316 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms