Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms