Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00315P59091 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms