Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YBEYP58557 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YBEYP58557 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBEYP58557 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBEYP58557 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBEYP58557 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBEYP58557 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBEYP58557 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBEYP58557 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBEYP58557 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBEYP58557 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBEYP58557 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBEYP58557 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBEYP58557 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBEYP58557 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBEYP58557 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBEYP58557 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBEYP58557 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBEYP58557 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBEYP58557 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBEYP58557 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBEYP58557 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBEYP58557 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBEYP58557 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBEYP58557 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBEYP58557 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBEYP58557 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
YBEYP58557 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
YBEYP58557 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
YBEYP58557 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBEYP58557 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YBEYP58557 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YBEYP58557 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YBEYP58557 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YBEYP58557 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YBEYP58557 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YBEYP58557 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YBEYP58557 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YBEYP58557 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBEYP58557 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBEYP58557 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBEYP58557 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBEYP58557 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBEYP58557 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBEYP58557 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBEYP58557 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBEYP58557 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBEYP58557 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBEYP58557 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBEYP58557 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBEYP58557 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBEYP58557 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBEYP58557 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBEYP58557 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBEYP58557 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBEYP58557 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBEYP58557 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBEYP58557 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBEYP58557 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBEYP58557 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBEYP58557 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBEYP58557 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
YBEYP58557 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBEYP58557 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBEYP58557 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBEYP58557 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBEYP58557 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBEYP58557 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBEYP58557 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBEYP58557 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBEYP58557 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBEYP58557 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms