Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCBP3P57721 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCBP3P57721 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCBP3P57721 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PCBP3P57721 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCBP3P57721 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCBP3P57721 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCBP3P57721 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms